Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PAXBP1Q9Y5B6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms