Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KCNIP3Q9Y2W7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms