Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FAN1Q9Y2M0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAN1Q9Y2M0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAN1Q9Y2M0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAN1Q9Y2M0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FAN1Q9Y2M0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAN1Q9Y2M0 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAN1Q9Y2M0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAN1Q9Y2M0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAN1Q9Y2M0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAN1Q9Y2M0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAN1Q9Y2M0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAN1Q9Y2M0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAN1Q9Y2M0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAN1Q9Y2M0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAN1Q9Y2M0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAN1Q9Y2M0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FAN1Q9Y2M0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAN1Q9Y2M0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAN1Q9Y2M0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAN1Q9Y2M0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAN1Q9Y2M0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FAN1Q9Y2M0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms