Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TRAPPC2LQ9UL33 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms