Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK05

GDF2, Growth/differentiation factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF2Q9UK05 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GDF2Q9UK05 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GDF2Q9UK05 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms