Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HMGXB4Q9UGU5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HMGXB4Q9UGU5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms