Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms