Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC88CQ9P219 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms