Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP5Q9NZZ3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP5Q9NZZ3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms