Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERVK13-1Q9NX77 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms