Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GJB4Q9NTQ9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms