Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RTN4Q9NQC3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RTN4Q9NQC3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms