Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LHX9Q9NQ69 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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