Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms