Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VAT1LQ9HCJ6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAT1LQ9HCJ6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms