Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NTN4Q9HB63 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms