Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC39A3Q9BRY0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms