Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PKNOX2Q96KN3 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PKNOX2Q96KN3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms