Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDX11Q96FC9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms