Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
EXOSC8Q96B26 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms