Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CSNK2A3Q8NEV1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CSNK2A3Q8NEV1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms