Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACBD4Q8NC06 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms