Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8G6

C15orf54, Putative uncharacterized protein C15orf54, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf54Q8N8G6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C15orf54Q8N8G6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms