Protein–RNA interactions for Protein: Q8N668

COMMD1, COMM domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD1Q8N668 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COMMD1Q8N668 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COMMD1Q8N668 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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