Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RASSF3Q86WH2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RASSF3Q86WH2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms