Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CACNA2D4Q7Z3S7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms