Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRSAM1Q6UWE0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRSAM1Q6UWE0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms