Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
GFI1BQ5VTD9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GFI1BQ5VTD9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms