Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CELF3Q5SZQ8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CELF3Q5SZQ8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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