Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
EFHC1Q5JVL4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFHC1Q5JVL4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms