Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC178Q5BJE1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC178Q5BJE1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms