Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SLC9B1Q4ZJI4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SLC9B1Q4ZJI4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9B1Q4ZJI4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9B1Q4ZJI4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9B1Q4ZJI4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9B1Q4ZJI4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9B1Q4ZJI4 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9B1Q4ZJI4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9B1Q4ZJI4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9B1Q4ZJI4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9B1Q4ZJI4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9B1Q4ZJI4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9B1Q4ZJI4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9B1Q4ZJI4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9B1Q4ZJI4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9B1Q4ZJI4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9B1Q4ZJI4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9B1Q4ZJI4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9B1Q4ZJI4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9B1Q4ZJI4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9B1Q4ZJI4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9B1Q4ZJI4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9B1Q4ZJI4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SLC9B1Q4ZJI4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms