Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SVEP1Q4LDE5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SVEP1Q4LDE5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms