Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYCP1Q15431 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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