Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 CYTH2-208ENST00000474049 576 ntTSL 212.16□□□□□ -0.464e-9■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 CYTH2-210ENST00000493260 4652 ntTSL 511.64□□□□□ -0.554e-9■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 CRACR2B-205ENST00000527763 1728 ntTSL 224.66■■□□□ 1.541e-9■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.011e-9■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.951e-9■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 CRACR2B-208ENST00000528694 2440 ntTSL 220.57■□□□□ 0.881e-9■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 CRACR2B-210ENST00000530688 1623 ntTSL 219.5■□□□□ 0.711e-9■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.411e-9■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 CRACR2B-203ENST00000526531 714 ntTSL 315.97■□□□□ 0.151e-9■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 GAS6-205ENST00000610073 2169 ntTSL 219.9■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 PLK3-202ENST00000461358 767 ntTSL 519.23■□□□□ 0.675e-8■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 UBXN6-203ENST00000587009 1967 ntTSL 218.74■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 UBXN6-206ENST00000590466 803 ntTSL 318.31■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 SPACA6-202ENST00000572160 759 ntTSL 517.36■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 UBXN6-204ENST00000587324 712 ntTSL 317.04■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 SPACA6-207ENST00000573266 1960 ntTSL 216.22■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 PLK3-206ENST00000492398 1135 ntTSL 313.66□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.221e-6■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 PLK3-203ENST00000461769 664 ntTSL 312.69□□□□□ -0.389e-8■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 AK2-213ENST00000551979 581 ntTSL 212.46□□□□□ -0.417e-12■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 SPACA6-210ENST00000576093 1894 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 SPACA6-211ENST00000576494 495 ntTSL 311.84□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.527e-12■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 PNKP-208ENST00000596624 548 ntTSL 49.7□□□□□ -0.867e-12■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 AGTPBP1-202ENST00000357081 4393 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 AK2-211ENST00000548559 530 ntTSL 48.53□□□□□ -1.047e-12■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 SPACA6-209ENST00000574072 480 ntTSL 38.33□□□□□ -1.081e-6■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 PNKP-226ENST00000636840 117 ntTSL 57.54□□□□□ -1.27e-12■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 AGTPBP1-203ENST00000376080 787 ntTSL 56.64□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 TLN1-208ENST00000495712 370 ntTSL 26.59□□□□□ -1.354e-8■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 AC005381.1-202ENST00000592716 574 ntTSL 55.85□□□□□ -1.471e-6■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 AGTPBP1-204ENST00000376081 914 ntTSL 55.62□□□□□ -1.511e-6■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 AGTPBP1-207ENST00000491784 789 ntTSL 34.03□□□□□ -1.761e-6■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.011e-6■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.515e-7■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.235e-7■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.345e-7■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.455e-7■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 CMIP-211ENST00000621537 4000 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.685e-7■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 GUK1-233ENST00000491613 959 ntTSL 312.35□□□□□ -0.431e-12■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 NUP85-202ENST00000449421 1287 ntTSL 211.04□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 NUP85-224ENST00000583948 1197 ntTSL 210.21□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 POLD2-206ENST00000436844 854 ntTSL 516.44■□□□□ 0.227e-7■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 AL035458.2-201ENST00000512005 478 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.422e-9■■■■■ 32.6
SF3B4Q15427 KDM6A-206ENST00000451692 671 ntTSL 39.63□□□□□ -0.872e-8■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 CTU2-207ENST00000565071 894 ntTSL 219.65■□□□□ 0.744e-8■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 PRMT3-206ENST00000529592 4159 ntTSL 24.21□□□□□ -1.743e-6■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 TIMM44-204ENST00000595876 1206 ntTSL 1 (best)12.53□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.261e-8■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.784e-9■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.894e-9■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -24e-9■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 MCM3AP-207ENST00000486937 4593 ntTSL 211.47□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 MCM3AP-201ENST00000291688 6193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.64e-7■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 MCM3AP-202ENST00000397708 6333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.844e-7■■■■■ 32.5
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SF3B4Q15427 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.817e-9■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 THOC6-208ENST00000574957 1143 ntTSL 1 (best)19.24■□□□□ 0.677e-9■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.447e-9■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 THOC6-206ENST00000574498 788 ntTSL 316.54■□□□□ 0.247e-9■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 THOC6-204ENST00000571057 988 ntTSL 1 (best)15.41■□□□□ 0.067e-9■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.37e-9■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.327e-9■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 FKBP2-204ENST00000535135 639 ntTSL 322.33■■□□□ 1.179e-12■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 MBD1-214ENST00000586679 533 ntTSL 314.02□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 MBD1-226ENST00000591661 482 ntTSL 313.04□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 KDM4B-212ENST00000624683 5076 nt13.31□□□□□ -0.281e-8■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 MKS1-203ENST00000393120 1926 ntTSL 212.76□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 PRRC2C-206ENST00000467601 717 ntTSL 28.39□□□□□ -1.074e-8■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 PRRC2C-205ENST00000463586 3771 ntTSL 25.88□□□□□ -1.474e-8■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 CXXC1-210ENST00000587396 476 ntTSL 216.43■□□□□ 0.227e-7■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 PCYT2-207ENST00000571581 999 ntTSL 523.44■■□□□ 1.344e-7■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 PCYT2-213ENST00000573401 1028 ntTSL 522.14■■□□□ 1.134e-7■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 AP2M1-206ENST00000432591 802 ntTSL 510.08□□□□□ -0.87e-7■■■■■ 32.5
SF3B4Q15427 VPS13D-209ENST00000487188 3990 ntTSL 26.33□□□□□ -1.44e-7■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.833e-11■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.763e-11■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 ZFYVE28-205ENST00000508184 541 ntTSL 415.53■□□□□ 0.083e-11■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.193e-11■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 GNAS-246ENST00000487981 581 ntTSL 59.36□□□□□ -0.911e-12■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 GNAS-254ENST00000494081 557 ntTSL 57.94□□□□□ -1.144e-9■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.175e-8■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 HNRNPL-212ENST00000601449 1918 ntTSL 514.84□□□□□ -0.035e-8■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.55e-8■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 HNRNPL-202ENST00000388749 1952 ntTSL 510.1□□□□□ -0.795e-8■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 PABPC4-214ENST00000483770 476 ntTSL 28.2□□□□□ -1.17e-9■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 PABPC4-220ENST00000525669 582 ntTSL 27.62□□□□□ -1.196e-9■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 SLC17A9-204ENST00000459704 2015 ntTSL 315.92■□□□□ 0.147e-8■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 HDAC10-210ENST00000475965 1239 ntTSL 1 (best)16.71■□□□□ 0.272e-10■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.826e-7■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 TFRC-211ENST00000475593 875 ntTSL 35.37□□□□□ -1.554e-16■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 NOP58-209ENST00000492688 571 ntTSL 44.25□□□□□ -1.731e-15■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 CDK10-219ENST00000567932 725 ntTSL 315.9■□□□□ 0.144e-18■■■■■ 32.4
SF3B4Q15427 ABCA8-204ENST00000541225 3657 ntTSL 24.93□□□□□ -1.621e-7■■■■■ 32.4
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