Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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GPNMBQ14956 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GPNMBQ14956 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
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GPNMBQ14956 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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GPNMBQ14956 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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GPNMBQ14956 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GPNMBQ14956 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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