Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL3Q13618 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CUL3Q13618 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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