Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KRR1Q13601 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KRR1Q13601 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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