Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TGM3Q08188 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TGM3Q08188 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms