Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SCN1BQ07699 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms