Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SOX4Q06945 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms