Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GABPB1Q06547 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms