Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUCB1Q02818 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUCB1Q02818 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms