Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
IRF8Q02556 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms