Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms