Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG7P83436 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG7P83436 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG7P83436 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG7P83436 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG7P83436 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG7P83436 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG7P83436 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG7P83436 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG7P83436 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG7P83436 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COG7P83436 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG7P83436 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG7P83436 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG7P83436 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG7P83436 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG7P83436 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG7P83436 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG7P83436 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG7P83436 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG7P83436 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG7P83436 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG7P83436 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG7P83436 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG7P83436 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG7P83436 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COG7P83436 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG7P83436 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG7P83436 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG7P83436 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG7P83436 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG7P83436 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG7P83436 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COG7P83436 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
COG7P83436 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG7P83436 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG7P83436 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG7P83436 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG7P83436 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG7P83436 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG7P83436 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG7P83436 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG7P83436 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG7P83436 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COG7P83436 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG7P83436 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG7P83436 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG7P83436 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG7P83436 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG7P83436 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG7P83436 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG7P83436 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG7P83436 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COG7P83436 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG7P83436 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG7P83436 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG7P83436 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG7P83436 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG7P83436 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG7P83436 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG7P83436 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG7P83436 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG7P83436 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG7P83436 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG7P83436 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
COG7P83436 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG7P83436 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG7P83436 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG7P83436 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG7P83436 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG7P83436 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG7P83436 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG7P83436 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG7P83436 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG7P83436 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COG7P83436 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG7P83436 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG7P83436 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG7P83436 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG7P83436 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG7P83436 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG7P83436 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG7P83436 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG7P83436 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG7P83436 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG7P83436 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG7P83436 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG7P83436 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG7P83436 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG7P83436 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG7P83436 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG7P83436 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG7P83436 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG7P83436 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG7P83436 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG7P83436 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
COG7P83436 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG7P83436 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG7P83436 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
COG7P83436 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms