Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERVPABLB-1P60509 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVPABLB-1P60509 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms