Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1B3P54709 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1B3P54709 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1B3P54709 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1B3P54709 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1B3P54709 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1B3P54709 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1B3P54709 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1B3P54709 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1B3P54709 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP1B3P54709 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP1B3P54709 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms