Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SMARCA4P51532 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SMARCA4P51532 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms