Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ME1P48163 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME1P48163 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME1P48163 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME1P48163 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME1P48163 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME1P48163 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME1P48163 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME1P48163 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME1P48163 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME1P48163 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME1P48163 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME1P48163 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME1P48163 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ME1P48163 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME1P48163 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ME1P48163 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME1P48163 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME1P48163 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME1P48163 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME1P48163 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME1P48163 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ME1P48163 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME1P48163 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME1P48163 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME1P48163 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME1P48163 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ME1P48163 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME1P48163 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME1P48163 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME1P48163 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ME1P48163 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME1P48163 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME1P48163 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME1P48163 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME1P48163 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME1P48163 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ME1P48163 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ME1P48163 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ME1P48163 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ME1P48163 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ME1P48163 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME1P48163 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME1P48163 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME1P48163 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME1P48163 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME1P48163 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME1P48163 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME1P48163 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME1P48163 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME1P48163 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME1P48163 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME1P48163 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME1P48163 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME1P48163 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME1P48163 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME1P48163 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME1P48163 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME1P48163 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ME1P48163 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME1P48163 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ME1P48163 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ME1P48163 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME1P48163 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME1P48163 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME1P48163 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME1P48163 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ME1P48163 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME1P48163 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ME1P48163 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ME1P48163 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ME1P48163 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ME1P48163 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ME1P48163 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms